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IT Data Engineer / Medizininformatiker / Bioinformatiker (m/w/d)

Ihre Tätigkeiten

  • Beteiligung am Aufbau eines Datenintegrationszentrums mit dem Ziel der Bereitstellung standardisierter klinischer Daten für die medizinische Forschung zur Verbesserung der Behandlung und Versorgung von Patient*innen
  • Datenextraktion aus klinischen Primärsystemen, Entwurf, Implementierung und Überwachung von ETL-Prozessen
  • Integration von heterogenen Daten, Datenharmonisierung, semantische Datenannotationen, Übernahme von Standardterminologien
  • Aufbau einer nachhaltigen IT-Infrastruktur sowie Entwurf und Etablierung von effizienten Prozessen für das Datenmanagement

Ihr Profil

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium (Master / Diplom) im Bereich der Medizin-/ Bio-/ Informatik oder eine vergleichbare Qualifikation für den o.g. Aufgabenbereich
  • Fundierte Kenntnisse in Linux (RedHat) und Containerisierung sowie in der Prozessierung und Verwaltung sensibler Daten unter Einhaltung höchster Sicherheitsstandards
  • Praktische Erfahrung mit Docker / Podman, REST APIs und ETL-Programmen sowie mit dem Aufbau von Datenprozessierungspipelines und der Harmonisierung heterogener Daten
  • Beherrschung aktueller Programmier- / Skript- / Abfragesprachen (z. B. Java, Python, JavaScript, SQL) sowie Shell-Skripting (Bash)
  • Erfahrung in der strukturierten Speicherung großer Datenmengen (SQL/noSQL-DBs, DBMS, Data Warehousing)
  • Erste Kenntnisse von Terminologien wie LOINC, SNOMED-CT, von Schnittstellenstandards wie HL7, FHIR, XML, DICOM und Erfahrungen mit medizinischen Informationssystemen wie KIS, PACS und LIS
  • Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse, verbunden mit der Erfahrung in der Zusammenarbeit mit multidisziplinären Teams
  • Selbständiger und strukturierter Arbeitsstil, gepaart mit einem souveränen, kompetenten und freundlichen Auftreten
  • Fähigkeit zur ziel- und lösungsorientierten Bearbeitung komplexer Problemstellungen

 

Weitere Informationen zu diesem Stellenangebot finden Sie bei unserem Partner Jobware.


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